故事以皇上怀疑朝中有人勾结扶桑企图叛国，故派包拯继续以密探身份查清案情，从而引出了一系列迷雾重重、离奇诡异的案件，讲述了陈键锋饰演的包拯见招拆招、剥丝抽茧，最终牵出幕后主使，维护国家百姓安全的故事。

本片改编自TYPE-MOON出品的文字冒险类游戏《Fate/staynight》，是该游戏最终路线“HF线”动画剧场版全三部作品中的第二章。通过女主角间桐樱的视角，讲述了御主和英灵为了得到可以实现一切愿望的圣杯而相互厮杀的一场战争。　　时隔10年在冬木市爆发的这场“圣杯战争”中，因被称为“圣杯战争”御三家之一的间桐家的当家·间桐脏砚的参战而变得更畸形、扭曲和恶化。作为御主参战的卫宫士郎也在战斗中负伤还失去了英灵Saber，尽管如此士郎为了守护间桐樱，并没有从战斗中引身退出。而担心士郎身体的樱，自己也无法逃离魔法师的宿命……

上古时代堕落邪神「冥海龙灵」侵袭「苦境」，却被圣兽「神龙」所击败，只剩下邪恶的元灵......为重⽣于世间，欲掀起武林浩劫⾎洗「苦境」，⽽汇聚神龙之⼒的「三青」意外现世，「冥海龙灵」忌惮融合「三青」之⼒的「龙骨圣刀」为⾃⼰带来命劫，欲杀「素还真」夺刀。　　魔域「阿修罗主宰」多年以前在修为无法突破境界之时，惊见「花信风」轻易地突破并获得邪刀「衍那魔刀」，身处如此至高无上的地位，却毫不留恋地离开魔域，令「阿修罗主宰」心生恨意，再次相遇的两⼈将会引起怎样的波澜？　　新一代的中原领袖「素还真」为了苦境和平与「一页书」两人联手，一明一暗，一层一层揭开垂涎苦境背后真正的黑暗势力，「一页书」与「半尺剑」在悬空棋盘谈论天下局势与「素还真」之生死，「一页书」又将揭穿怎样惊人的真相，「半尺剑」又带著什麽不为人知的目的，这盘棋局究竟谁能胜利？